少年三国志零与少年三国志1的核心差异体现在玩法框架与策略深度上。前者独创4×4布阵系统，颠覆传统卡牌游戏的固定站位模式，玩家需根据六大兵种（盾兵、步兵、轻骑、重骑、弓手、谋士）的克制关系动态调整阵容，而后者更偏向常规的线性阵容搭配。零引入128名士兵同屏激战机制，强化战场沉浸感，而1代更注重武将个体养成与技能组合。两者虽同属三国题材卡牌，但零通过兵将军师协同体系，将策略维度从单一武将扩展到全兵种协作。
游戏进程设计上，少年三国志零采用赛季制玩法，每月更新沙盘演武、巅峰论战等限时内容，强调动态策略调整；少年三国志1则以静态副本推进为主，通过固定关卡积累资源。零的军师系统具备五行技能融合机制，计谋释放时机直接影响战局走向，而1代的军师功能更偏向被动增益。零的演武场设计包含华容道塔防、长坂坡守卫等复合玩法，1代则延续传统推图模式，策略层次相对单一。
少年三国志零的主将需配合羁绊与兵种特性构建流派，如毒爆流、控制流等，且红武魂系统随机性较高；少年三国志1更依赖彩金将的固定搭配与数值成长。零的武将技能存在连锁效果，如周瑜火攻与司马懿毒伤的复合伤害，1代技能联动则以固定合击技为主。零的鲁肃、貂蝉等武将具备战场复制机制，1代武将技能设计更遵循传统回合制逻辑。
社交与地图探索方面，少年三国志零的九州争霸采用三局两胜制，需配置多套阵容应对，联盟玩法包含跨服夺城；少年三国志1的社交以公会副本为主。零的大地图无缝衔接九州，含随机事件与商人交互，1代地图为章节式线性结构。两者日常任务机制相似，但零的活跃度奖励更侧重爵位提升，1代资源投放集中于武将突破材料。
