在口袋妖怪白金光的三周目阶段，部分道馆的进入条件与特定徽章的获取直接相关。鬼系道馆是典型代表，玩家需先获得水系徽章才能解锁其挑战权限。该道馆位于临港市附近，馆主阵容包括Lv.35回声气球、Lv.37梦巫、Lv.38黑暗之人和Lv.40耿鬼，胜利后可获得幽灵徽章及TM30暗影之球，同时解锁怪力技能的使用权限。道馆内部采用传送门机制，需按特定顺序通过右下、左下等传送节点才能抵达馆主所在位置。
龙系道馆是另一个需要前置徽章的关键设施，玩家需集齐七个基础徽章后方可挑战。该道馆位于御龙市，馆主精灵等级普遍达到Lv.58-Lv.64区间，包含刺龙王、沙漠蜻蜓等高阶龙系宝可梦。战胜后获得的龙爪徽章不仅象征道馆挑战的完成，更是解锁登瀑术秘传技能的必要条件。该道馆内部设有机关系统，需要操作开关才能开启通往馆主的道路，这种设计在三周目道馆中较为常见。
水系道馆作为三周目前期必经之路，其徽章同样是后续探索的重要钥匙。该道馆要求玩家先完成草系道馆挑战，馆内采用水位控制机关，精灵阵容以Lv.32-Lv.35的水系宝可梦为主。获胜后取得的海洋徽章除常规功能外，还允许玩家在野外使用碎岩术，这项技能对后续神兽捕捉路线的开拓至关重要。部分区域如黄绮岛的剧情推进，也直接依赖该徽章的获取进度。
钢系道馆与冰系道馆虽然不强制要求特定徽章，但实际探索中需要依赖前序道馆奖励的技能机器。钢系道馆所泽理洞窟必须使用攀岩技能才能抵达，而该技能通常需通过中期道馆挑战解锁；冰系道馆所冰暴洞窟同样存在类似设计。这种间接的徽章依赖关系，使得玩家必须按照特定顺序推进道馆挑战，无法完全自由选择攻略路线。两个道馆的馆主均配备Lv.40级别的传说宝可梦，战斗难度显著高于一周目水平。
三周目新增的神兽捕捉区域往往与道馆徽章形成联动机制。例如垂暮森林的雪拉比捕捉点需要幽灵徽章支持，而捕捉海皇牙的潜水区域则必须持有海洋徽章。这种设计将道馆挑战与神兽收集有机结合，使徽章系统在游戏后期仍保持核心地位。部分隐藏洞穴如祁连洞窟的岩神柱捕捉点，还需组合多个徽章解锁的技能才能到达，进一步强化了道馆攻略的顺序性。
三周目的道馆挑战呈现出明显的递进式结构，通过徽章与技能的组合要求引导玩家遵循特定攻略路径。这种设计既延续了系列传统的进度控制系统，又通过神兽捕捉等新增内容赋予徽章更丰富的功能性价值。对于追求全图鉴的玩家而言，准确掌握各道馆的徽章依赖关系，是高效完成三周目内容的关键所在。
